הישוב נקרא על שם חמישה כפרים שהיו קיימים באזור בתקופת המשנה והתלמוד ושמו היווני נשתמר בשם הכפר פנדקומיה (פנטה= חמש ביוונית). בשנת 1978 חומש הוקמה כגרעין נח"ל בשם "מעלה נח"ל" על הר גבוה הצופה אל מרחבי עצומים "מגדרה עד חדרה" (650 מ' מעל פני הים) בשנת 1981 אוזרח המקום והפך ליישוב קהילתי חילוני במוא"ז שומרון של התנועה המיישבת העובד הלאומי. בשנות ה90 התווספו לגרעין המייסד קבוצה גדולה של משפ' עולות מדינות חבר העמים, בתחילת שנות ה2000 הגיעו ליישוב מס' זוגות צעירים דתיים אשר השתלבו במארג החברתי המיוחד שנרקם ביישוב ואף הוקמה במקום ישיבה.