מרכז מורשת גוש קטיף וצפון השומרון יוזם ומפיק מספר כנסים בשנה ובשיתוף פעולה עם גופים מגוונים:
כנס לכיש עם מדרשת הדרום, כנסים בנושאים הנוגעים להיסטוריה של רצועת עזה עם המכון למחקרי בטחון לאומי, INSS, כנס שומרון בנושאים היסטוריים וארכיאולוגיים ועוד.
הכנס המרכזי השנתי הינו כנס קטיף לאחריות לאומית ומציין את התאריך העברי של העקירה מגוש קטיף ומצפון השומרון . למידע נוסף על כנס קטיף לחץ/י כאן